La decima campagna di scavo nel sito della città greco-romana di Phoinike si è svolta nel periodo compreso tra il 6 e il 26 settembre 2009 e ha coinvolto complessivamente 20 persone, tra studenti e docenti, albanesi e italiani, nonché numerosi operai e operatori locali. Gli studenti hanno potuto partecipare sia alle consuete attività della Missione (ricognizioni, scavo archeologico, rilievo) sia ad una Summer School attivata in concomitanza allo scavo. Purtroppo le ridotte disponibilità economiche hanno determinato una forte riduzione delle attività di restauro - sempre presenti tra le priorità della Missione - a vantaggio di più mirati interventi di conservazione, effettuati principalmente da Klejdi Zguro, allievo negli anni 2008-2009 del Centro Italiano per il Restauro Archeologico di Saranda, direttamente sullo scavo archeologico oppure tra i materiali recuperati che presentavano seri problemi di conservazione.

Le nuove indagini del 2009 sono state articolate su quattro settori di intervento, che verranno di seguito illustrati nel dettaglio: l’indagine dell'area intorno alla basilica paleocristiana (direzione di Marco Podini, Albana Meta), la continuazione dello scavo del teatro (direzione di Riccardo Villicich), una campagna di saggi mirati sull’acropoli (direzione di Enrico Giorgi, Julian Bogdani) e lo scavo della necropoli meridionale (direzione di Giuseppe Lepore, Belisa Muka). Parallelamente ha operato un Laboratorio di schedatura e studio del materiale archeologico, coordinato da Anna Gamberini, con l'ausilio di Erika Vecchietti.